Да, действительно, если подконтрольный товар хранится и перемещается в рассоле, то необходимо указывать два варианта объема такой партии: с учетом рассола и без. Но на данный момент при оформлении производственной транзакции возможно указать только один вариант объема (присутствует только одно соответствующее поле).
В настоящий момент действует порядок, указанный в разъяснении: https://fsvps.gov.ru/ru/fsvps/news/39360.html Система в данной части будет дорабатываться.
Такой ответ пришел мне вчера от [Поддержка Меркурия - Поддержка #755288] mercury@fsvps.ru